การกำเนิดยีสต์นั้นยังไม่เป็นที่ทราบแน่ชัด แต่มีทฤษฎีที่เป็นไปได้อยู่หลายทฤษฎี หนึ่งในทฤษฎีที่เป็นไปได้มากที่สุดคือ ยีสต์มีวิวัฒนาการมาจากแบคทีเรียที่มีความสามารถในการหมักน้ำตาลเป็นแอลกอฮอล์